《深夜的超自然公务员》讲述了这样一个故事:在东京 23 区的全部区役所中有个不为人知的组织“夜间地域交流课”,专门处理夜晚各种超自然事件。宫古新是“夜间地域交流课”的新人,可以理解人外语言,在巡逻的时候遇到了一位天狗,将宫古新称为安倍睛明,在天狗看来宫古新与自己认识的安倍睛明一模一样,宫古家是继承了安倍睛明的血脉。作为“夜间地域交流课”的新人宫古新一方面会与各种妖怪们接触,另一方面也要和充满个性的同事们学习相处之道。
深夜的超自然公务员剧情:第1集 新宿上空的天狗与天使
宫古新从春季开始被分配到新宿区政府“夜间地域交流科”。这个科的前辈,有埋头于可疑饰演的姬冢西奥,有原来做公关业务的领导榊京一。然后,在今晚的现场——新宿,新看到了妖精、天使和天狗,这些不为人知的“另类生物”。夜间地域交流科的工作,是解决与另类生物有关的超自然现象。看到互相仇视的天使和天狗,榊和西奥打算制止地盘争端的激化,然而新却没有看出来是这样的争斗……